澳洲CRISPR 2.0:澳大利亚科学家推出新的 DNA 编辑工具

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Sandro Ataide 博士 15 年前与 Jennifer Doudna 教授一起酿造啤酒展示她在 CRISPR 方面的获奖成果,这项基因编辑技术彻底改变了我们的世界,从拯救生命的疗法到第一个转基因婴儿。

现在,与大学里一个小而强大的团队合作悉尼的,他可能比她领先。

Sandro Ataide 博士(中)与同事 Ruth Hall 教授(左)和 Rezwan Siddiquee。 图片来源:Jessica Hromas

Ataide 和他的同事开发了一种比 CRISPR 更灵活、更精确的基因编辑技术,可以允许科学家对 DNA 进行准确且更显着的改变。

“这根本不是 CRISPR,而是一种全新的基因编辑工具,可以通过编程将部分 DNA 从一个位置移动到另一个位置。”阿泰德说。

操纵代码赋予生命本身的能力是本世纪科学的伟大飞跃之一。基因编辑器已经使用 CRISPR 来治疗镰状细胞贫血症,并且更多治疗肌营养不良症、亨廷顿病、癌症和阿尔茨海默病的疗法正在临床研究中。

但是 CRISPR 可能会给 DNA 和治疗带来危险的变化使用基因编辑的成本超过 200 万美元。那么这个新工具如何改变游戏规则呢?

借自细菌

CRISPR源自细菌的免疫系统,它使用酶来切割入侵病毒的DNA。劫持这项技术可以让科学家切割 DNA 并插入自己选择的新序列,从而编辑基因。

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但是 CRISPR 既需要一把从细菌借来的分子“剪刀”,又需要一个单独的剪切和粘贴功能来插入所需的编辑。这个两步过程限制了 CRISPR 可以调整的遗传物质的长度。

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CRISPR 还容易进行脱靶编辑,在 DNA 中引入不需要的和潜在危险的突变。每当你切割 DNA 时,你都会面临造成致癌风险的风险。

Ataide 的同事表示,澳大利亚科学家的新技术,称为eekRNA,可以一次优雅地执行基因剪切和粘贴操作。 Nature Communications 论文 Rezwan Siddiquee 的主要作者,从而大大降低了脱靶突变的可能性。

“它既可以切割 DNA,也可以粘贴 DNA,所有这些都在一个系统中, “西迪奎说。 “所以你基本上可以用一种更简单的方式重新编程,而且它比 CRISPR 更加具体。它彻底改变了编辑领域的游戏规则。”

“跳跃基因”:新工具如何工作

团队招募了关键的 RNA(它使 DNA 能够充当遗传指令) )来自“跳跃基因”或转座酶的特定家族,转座酶是在基因组上移动的遗传物质片段。

自然游牧的遗传物质锁定在极其特殊的基因上。DNA 链上的特定“目标位点”。

Ataide 和他的团队重新编程了该系统,以对细菌 DNA 进行精确编辑。由于eekRNA是一个小而光滑的包装,研究人员相信他们的技术可能更容易传递到细胞,从而开展可以支持新的COVID-19疫苗并降低数百万美元的基因治疗成本的研究。

“CRISPR 并不是一个完美的工具。它有时会带来意想不到的变化,”杜德纳上个月在悉尼歌剧院的演讲中承认。她说,该领域的新前沿研究将是科学家们找到使 CRISPR 更高效、更便宜、更容易进行治疗的方法。

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Jennifer Doudna 教授上个月在悉尼歌剧院发表演讲时警告说基因编辑卵子、精子或胚胎。图片来源:Anna Kucera/悉尼歌剧院

在一场国际竞赛中为了开发下一代基因编辑工具,Ataide 和他的同事已经为他们的技术申请了专利,并开始了下一阶段的研究:在真核细胞(植物、动物和人类的细胞)内测试eekRNA。 Siddiquee 说,如果这有效,那么“这里就有无限的潜力”。

辣番茄和非法婴儿

CRISPR 作为一种基因编辑工具在大约十年前突然出现,而且使用起来也比较方便。我们才刚刚开始研究它的应用。科学家们正在研究 CRISPR 的多种用途,包括消除坚果中引发过敏的蛋白质、脱去咖啡豆的咖啡因、制作辣番茄以及治疗斑点狗的膀胱结石(可怜的小狗有患这种疾病的遗传倾向)。

有一天,基因编辑也可以消除人类中的 1 型糖尿病和囊性纤维化等疾病。它还在应对气候变化方面发挥着作用;杜德纳正在与加州科学家合作,试图禁用导致奶牛打嗝和放屁的大量甲烷的细菌基因,甲烷是一种导致全球变暖的温室气体。

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贺建奎透露他在两个人类婴儿身上使用了 CRISPR,震惊了科学界。图片来源:美联社

但所有这些奇迹都伴随着一个警告,杜德纳说,当中国科学家何建奎在 2018 年宣布他对两个婴儿(绰号为露露和娜娜的双胞胎)使用 CRISPR 时,她感到“震惊”。声称会让他们对艾滋病毒免疫。

建奎很快就被判入狱,但自从出狱后,他又回到了实验室研究 CRISPR。

随着这项技术变得越来越便宜。更准确地说,我们将看到更多这样的争议,掩盖了我们重写生命代码的新能力所带来的巨大科学和医学前景。

Doudna 心中明确的道德底线是使用 CRISPR 和其他 DNA -调整工具对人类基因进行可遗传的编辑。

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“当我们谈论镰状细胞病或 CRISPR 的其他应用时,这些都是影响个体的基因编辑的用途,”杜德娜说道。 “它们不会产生可遗传的变化并传递给后代。

“但对胚胎、卵子或精子进行编辑就可以做到这一点——它会产生可遗传的变化。为什么会出现这样的问题呢?嗯,当你开始思考这个问题时,它会让你想到像优生学这样的事情……可能使用 CRISPR 的方式会造成比我们世界上现有的更多的不平等。”

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