澳洲悉尼大学获100万澳元资助用于考拉基因组测序

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联邦环境部长Sussan Ley和新南威尔士州环境与能源部长Matt Kean今天宣布资助悉尼大学科学家对400只考拉基因组进行测序,以深入了解这一脆弱物种。



悉尼大学接受了100多万元的捐赠,将对东部沿海地区数百只考拉基因组进行测序,以保护该物种免受疾病和其他威胁。

联邦环境部长Sussan Ley和新南威尔士州环境和能源部长Matt Kean今天在校园里宣布了这笔资金。

联邦将投资348,450澳元用于昆士兰和维多利亚州考拉的基因组序列,以及一名研究人员在2021年开发基因组库,而新南威尔士州政府将出资674,000澳元用于新南威尔士州种群考拉的基因组序列。

亚马逊网络服务(AWS)通过其开放数据赞助计划,为悉尼大学承担他们参与该项目期间的数据存储和传输费用,以便世界各地的研究人员可以在云端进行访问和分析。

该项目将对已经掌握的样本库进行基因图谱绘制,并在未来几年内通过国家考拉监测计划和今年即将敲定的考拉恢复计划进行建立。该项目建立在最近由悉尼大学和澳大利亚博物馆领导的考拉基因组世界首次测序的基础上。

悉尼大学校长兼首席教授Stephen Garton感谢联邦和新南威尔士州环境部长以及亚马逊的支持,这将使400只考拉的基因组测序成为可能。

"这是一个基础数据集,将加快我们对东部沿海考拉的了解--特别是对这一脆弱物种未来适应潜力的了解,"Garton教授说。

联邦环境部长Sussan Ley说。"这是一项突破性的科学,从未以如此规模应用于本地物种种群,它将在加强考拉种群方面发挥重要作用。"

新南威尔士州环境和能源部长马特-基恩说。"我们知道考拉面临的头号威胁是栖息地的丧失和破碎化,但考拉也面临着疾病和气候变化等威胁的风险;我们需要使出浑身解数来支持繁荣和有弹性的考拉种群。"

比较基因组学教授凯西-贝洛夫(Kathy Belov)是2018年对第一个考拉基因组进行测序的团队成员,她说,历史上考拉种群在东海岸自由移动,但随着种群变得分散,维持遗传多样性的重要性增加。

"一个种群的遗传多样性水平决定了该种群能够如何适应和应对变化,无论是疾病、行为还是气候,"兼任副校长(全球参与)的贝洛夫教授解释说。

该大学生命与环境科学学院大洋洲野生动物基因组学组的高级研究经理Carolyn Hogg博士表示,该项目将为考拉保护创造遗产,是其整个范围内的一个时间点,并能够根据这个参考点测量未来的变化。

"基因组为我们提供了创建一套下游应用的能力,这些应用都可以用于长期管理该物种,"Hogg博士总结道。

关于测序。
全基因组测序意味着研究人员将能够回答一系列与种群规模、未来适应潜力、疾病和繁殖等有关的问题。它还将使他们了解一些种群是否具有独特的遗传变异。这对于那些受到威胁的种群来说尤其重要,可以确保在这些独特变异消失之前将其捕获;对于那些具有独特变异、需要投资于生境恢复或扩大现有生境的种群来说也是如此。

开放的数据访问将确保基因组数据在产生时可供任何研究人员使用。

这是一个基础性的数据集,它将加快对考拉的了解--特别是在气候变化和该物种的适应潜力方面。

来源:https://www.sydney.edu.au/news-o ... quence-genomes.html
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