澳洲来自海水的 DNA 预示着革命

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澳大利亚科学家正在使用人类医学中常用的 DNA 技术来发现海洋中的生物以及海洋中的生物——一次 5 升。

这是一个不起眼的开始,但这项技术有可能彻底重塑在全球范围内开展海洋保护工作。

这项耗资 4000 万美元的计划是矿业亿万富翁 Andrew Forrest 的慈善明德鲁基金会与世界上最大的基因组测序公司 Illumina 之间的合作伙伴关系。

他们共同合作已经表明,通常在稳定的温控实验室中发现的复杂的高通量测序设备可以成功地部署在摇摆不定的研究船上。

概念验证试验大大缩短了它的时间需要识别在水中移动时脱落的 DNA 海洋生物。

环境 DNA - 或简称为 eDNA - 非常有价值,因为它可以告诉研究人员哪些物种最近在特定位置,以及可能的体积。

Steve Burnell 博士领导 Minderoo 的 OceanOmics 研究项目。

他说,安装在 Pangea Ocean Explorer 上的实验室成功分析了连续采集的 5 升样本来自澳大利亚海岸的不同地点。

结果在一两天内就在海上获得了,而以前需要数周或数月的时间,并且需要将水样送到专业实验室。

Burnell 博士说,要将 eDNA 转变为对科学和海洋保护具有全球意义的工具,还有大量工作要做,但它的潜力是显而易见的。

例如,它可以用于检测海洋公园的入侵物种。它还可用于跟踪气候变化如何影响物种的传播,并密切关注商业鱼类种群的状况。

伯内尔博士说,要达到这一点还有很多工作要做。 Minderoo 已经在着手解决其他难题,包括建立一个海洋物种研究基因组库。

“如果我出去寻找海水中的 eDNA 并告诉我有某种金枪鱼或在特定区域的鲨鱼,我首先需要知道各种金枪鱼和鲨鱼的参考基因组,以便与它进行比较,”他说。

但到目前为止,只有 20,000 种已知物种中的百分之一海洋鱼类的基因组已被测序。 Minderoo 正在努力改变这一点。

“参考基因组有效地提供了字典,使我们能够使用 eDNA 彻底改变海洋保护。我们正在对两者进行投资。”

Illumina副总裁 Gretchen Weightman 说,船上试验首次证明海上高通量测序可以在几个小时内产生有价值的遗传信息。

“环境 DNA 在监测淡水、海洋和陆地生态系统。重要的是要证明我们的核心技术是强大的并且可以在标准实验室设置之外运行。”


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