《悉尼晨锋报》12月10日报道，悉尼研究人员研发了一种全新的基因组测序技术，可在4小时内发现感染源。
St Vincent's医院的Garvan Institute of Medical Research和UNSW的Kirby Institute与NSW Health Pathology合作，采用了一种现有的测序技术，以更快追踪新冠病毒感染源。
上周，这项被称为Nanopore的技术在一天之内确定了隔离酒店一名确诊清洁工的感染源，她感染的是一种海外变异病毒。此前，病毒基因组测序需要2、3天的时间。
NSW Health Pathology的Prince of Wales实验室的Bill Rawlinson表示：“要想知道一种病毒的整个序列需要等上好几天，但如果你只想知道一种病毒与世界上其它病毒的关系，则只需要等几个小时。”
Rawlinson表示，这名隔离酒店员工很可能没有在社区感染病毒，这一发现为接触追踪提供了帮助。
进一步测序后，通过鸟枪测序法及其它调查，卫生部门推断她的感染源是一名住在酒店隔离的美国航空公司的机组人员。
鸟枪测序法通过绘制病毒变化过程，确定病毒从何处获得。该技术将悉尼西南区Crossroads酒吧群聚感染与维州的疫情联系起来，以及将阿德莱德一系列确诊与一名从英国归国的酒店隔离者联系起来。
这些结果需要几天时间才能得出，但Nanopore只需要4个小时，因为该技术对可测序的DNA片段的长度没有上限。
Garvan基因组技术小组负责人Ira Deveson表示：“Nanopore是基因组学领域中的新生事物。”使用Nanopore进行基因组测序的过程与鸟枪法基本相同，即从样本中分离出病毒，然后进行扩增。
（图片来源：《悉尼晨锋报》）
但鸟枪法只能对100至150个基因字母的较短片段进行分析，Nanopore则以单分子DNA（RNA）通过生物纳米孔的电流变化推测碱基组成而进行测序。
Deveson表示：“它大大节省了测序时间，这对病毒研究和接触追踪十分关键。”
据悉，尽管此前有人对这项技术的准确性提出了质疑，但新的研究发现，Nanopore在对新冠病毒进行测序方面有极高的准确性，在157个确诊患者样本中检测出病毒变体的灵敏度和准确度均高于99%。
（Joy）
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