使用悉尼研究人员开发的新基因组测序方法,可以在4个小时内发现新冠病毒感染的来源。
St Vincent’s医院Garvan医学研究所和新南威尔士大学Kirby研究所的研究人员与新州卫生部门合作,采用了最新的测序技术,可以更快地追踪新冠病毒感染来源。
上周使用了被称为纳米孔的测序技术,该技术可在一天之内确定隔离酒店Novotel的清洁人员所感染的新冠病毒为该病毒的海外变种。在这之前,病毒的基因组测序需要两到三天才能确认。
“如果想知道病毒的整个序列是什么,那还是需要等上几天,但是如果只想知道它与世界上其他病毒的联系,那么可以在当天甚至只要几个小时内就可以了。”新州健康病理学Prince of Wales实验室的资深医学病毒学家Bill Rawlinson教授说。
Rawlinson教授还说,快速确认这名女士不是从社区中感染到的新冠病毒,就可以让接触者追踪工作不过于紧迫。
然后进一步使用已建立的“散弹枪”基因组测序方法以及交叉询问,卫生当局最终推断出她的感染来源于居住在酒店的美国机组。
基因组测序是一种反应病毒变化以确定其来源的过程。
基因组测序这一技术之前被用来将悉尼西南部Crossroads Hotel的新冠疫情与维州的病例相关联,最近还将阿德莱德的一连串病例与从英国回来的隔离在检疫酒店的归国旅客相关联。
之前得出结论每每花费几天的时间,但纳米孔技术可以在四个小时内就拿到结果,因为该技术对可测序的DNA片段长度没有上限要求。
在周四发表于《自然通讯》上的一篇论文中,研究人员提供了使用该技术进行新冠病毒追踪的分析验证和最佳实践指南。
Garvan基因技术小组负责人Ira Deveson博士说:“纳米孔是基因学领域中的新生事物。使用纳米孔进行基因组测序的过程与“散弹枪“测序基本相同。“
但是区别在于“散弹枪“测序需要将100至150个基因片段”缝合“在一起进行分析比较,而纳米孔技术则可以从端口不停的接入基因片段持续测量分析。
Deveson博士指出:“准备该实验和运行该实验所涉及的步骤要快得多,大大减少了得出结论的时间,这对于新冠病毒研究以及接触者追踪工作至关重要。”
纳米孔测序所使用的仪器也只有智能手机般大小,配合笔记本电脑一起使用,这提供了可以直接在医院进行测序的机会,而不是非要将病毒基因发送到实验室才能分析检测。
研究人员先前曾使用纳米孔测序技术来应对西非的埃博拉疫情。
尽管先前的研究对这项技术的准确性提出了质疑,但最新研究发现,纳米孔测序在新冠病毒方面具有很高的准确性,可以在157个新冠病毒标本中检测出具有99%以上准确性的病毒变体。
Rawlinson教授承认,他认为该方法没有“散弹枪”测序精准,但与其他基因组测序方法一样,在新州卫生病理学部门的新冠病毒追踪溯源中将占有一席之地。
他认为纳米孔技术在像Novotel清洁人员感染这样的情况下最有用,因为在这种情况下,需要快速了解病毒的大致来源。
原文链接:https://www.smh.com.au/national/ ... 0201207-p56l8j.html
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好!
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美国吗?
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厉害
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好
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厉害了,不是靠猜进口物品表面。
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厉害了,澳洲有些技术还是很先进的
感谢楼主辛苦编译
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是在物品里面?
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